Den vil jo selvsagt ikke slette noen SMS.
Den vil bare benytte plassen som er tilgjengelig på telefonen.
Denne blir delt mellom SMS, MMS, Ringetoner, Sanger, Bilder, Filmer, TV-serier, Programmer...... osv.
Dette betyr at så lenge du har plass igjen på din harddisk så kan du lagre flere SMS.
Om du vil arkivere SMS, MMS, samtale logger etc utenom den sikkerhetskopien som blir laget når du kobler iPhone til maskinen din, så kan du jo sjekke denne om du har Mac:
http://ecamm.com/mac/phoneview/